自弘治十二年始，由皇太子主持，亲自对马政的官员系统进行梳理，也重新政整治了全国的官牧马场。
在京师，他支持太仆寺卿梁储对行政机构进行改革，太仆寺统管全国官牧马场，包括养马、调度、输军等等各个流程，也不再分设各监，而以‘司’来进行条线管理。地方则设行太仆寺，直接向中央的太仆寺负责。
在地方，他则支持杨一清全面整顿陕西各处官牧马场。
春月草长，纵马于苑。迨冬草枯，则收饲之。至弘治十七年，
陕西马政在杨一清的治理下已经焕然一新，他自己上疏：臣遍历其地，酌定三等，开城、安宁为上苑，岁马可二万匹；广宁、万安为中苑，岁可八千匹；清平、黑水为下苑，岁可四千匹。
朱厚照还记得呢，弘治十二年时，陕西马场只有两千多匹马……
除此之外，苑马场也在增加，今年就在平凉府新建了一处安定苑，也是可以岁马两万匹的上苑。
数字的确是漂亮了一点，
其实历史上，杨一清就是署理陕西马政非常得力，永乐年间全国有96苑官牧马场，至明末时只余9苑……从陕西来看，永乐时设有24苑官牧马场，弘治时只余6苑，加上今年新增设的，7苑……
这么惨烈的数据背后，在弘治后期到正德初期，杨一清署理马政期间，马政的情况竟然大有改善。
不过，等杨一清离任后，仅十来年后的嘉靖年间，陕西马政的情况又都恢复原样。
当然，尽管官牧马场的情况大有改观，但马匹总量不足的总特点没有改变。
杨尚义的骑兵部队更是要那种可以战斗的精壮马匹。
不止如此，实际上骑兵部队看到的是一匹马，一旦战斗，后面得有三匹马跟着作为保障，
首先是战争中的马匹伤亡很大，
其次马所需的粮食也很多、而且很精，需要运输……基本上一匹精良战马的粮食，可以养活25个人。
所以不是把马养出来，就有厉害的骑兵部队的，它只是个必要条件。
人吃马嚼的，喂养出几十万大军真的也很难。
至今，杨尚义的骑兵不过四卫人马，共计两万两千人。
后人想象中的二十万或者三十万骑兵，不是国力鼎盛时期，根本就养不起。
但好在朱厚照也才十四岁，他还有时间。
这是不讲究政治，讲究实效的层面。
在政治层面，
杨一清这个人让朱厚照很纠结，因为杨一清可和刘大夏关系很好。
事实上，正儿八经的历史中，杨一清之所以能从南京那边的闲职忽然变成山西巡抚这样的封疆，就是得了刘大夏举荐。