在第二次收复中东铁路中前后，〖中〗国方面共计收拢战俘一万四千人，然而在最后关头，王茂如强令战俘发起自杀式冲锋，攻克中东铁路司令部。仅一天的时间，死在中东铁路司令部〖广〗场前的战俘就有四千人之多，铁路〖广〗场简直成了屠宰场。
而在战俘身后的督战队，也将逃跑的战俘处决，人数高达一千人之多，等到全部占领中东铁路司令部后，与白俄同归于尽被炮弹和**包炸死的也高达一千多人，伤者更是不计其数。最终活下来的战俘仅有七千余人，其中身体健康的只有三千余人了，三千余人战俘重伤或者轻伤的战俘，另外有接近两千的难民也囊裹在俘虏之中。
对于这些战俘，王茂如下令能够救治的救治，并连同健康者迅速转移到齐齐哈尔的矿山中开矿，而重伤者则在医院中以救治的名义秘密处决。当然，这些战俘也被分门别类，鉴定的红俄被分一类，白俄分一类，闹事的分一类，难民被分一类，很多红俄的骨干都被秘密处决，不管他们是主动投降还是被动投降。而至于白俄士兵，待遇稍好一点，王茂如将他们分了出来，问他们是否愿意当雇佣兵，很多白俄士兵都欣然接受。白俄士兵明显比红俄士兵更具有战斗力，他们才是真正的职业军人，王茂如留下来不到六百人的白俄雇佣兵，这白俄雇佣兵只听王茂如一人指挥。倒是省了很多事。
之后王茂如下令费朝贵第六师向南移动进入哈尔滨市。这样哈尔滨东有第三师，哈尔滨南有第二师，哈尔滨市内有第一师和第六师。
为了防止长春的外阿穆尔军区俄国东西伯利亚第三兵团，王茂如下令，令第六师与第一师共同协防双城堡，准备迎击长春的东西伯利亚第三兵团的随时反扑。下令第二师撤回哈尔滨进行修正和补充，作为第二梯队。同时王茂如紧急命令后方的郭松龄，在呼伦城将归国铁路工人迅速组建为补充旅，两万人临时组建的三个补充旅支援上来，补充各个部队中损失的士兵。
这三个补充旅是当初曾经在俄国远东修筑铁路遭到俄国人迫害的〖中〗国工人。对俄国人充满了仇恨。而其中宣扬布尔什维克主义的人，也被秘密地调走，不知所踪了。
为了支援宫小旗第四师在满洲里的战斗，王茂如下令盖天久的第五师从齐齐哈尔调往呼伦贝尔。支援宫小旗的战斗。委任宫小旗为黑龙江陆军西路军总指挥，盖天久为副总指挥。事实上，第五师战斗力最强的部队就是原警卫旅和原宫小旗所属的骑兵旅，而汲金纯的奉军改编而成的第十五旅怎看也让人不放心。不过正是因为宫小旗是骑兵将领出身，第五师划归他指挥之后，将发挥更大的战斗力。
收复之后的哈尔滨破败不堪，经过两次战役和数次战斗，东方莫斯科之称的哈尔滨，如今变得残垣断壁，家园尽毁。许多百姓面对虽然是回到祖国怀抱却是废墟一片断家，心中百味俱全。
王茂如在占领哈尔滨之后，首先宣布，黑龙江陆军不会侵犯各国在哈尔滨的利益和权力，保证各国侨民的人身安全和财产安全，同时，邀请吉林督军孟恩远商讨如何安顿哈尔滨，组成黑吉联军。王茂如主动让贤，将黑吉联军的总司令位置让给孟恩远，自己只担任副总司令和总参谋长。